背景
地鐵荃灣線在1982年5月通車，九巴除了把部份地鐵接駁線縮短路線外，還在元朗開辦68M線，來往元朗(西)至荃灣地鐵站。大欖隧道通車後，路線一度改為朗屏至葵盛圍，但很快便打回原形，回復來往元朗(西)至荃灣地鐵站，並一直維持至今。
路線演變史
68M線開辦時，在元朗(西)開出後，途經青山公路元朗、屏山、洪水橋及藍地段，然後駛入屯門公路及青山公路荃灣段，並在元朗及屯門沿線設有分站，路線一直維持至大欖隧道通車為止。
大欖隧道在1998年5月25日下午通車。翌日，九巴大部份元朗或天水圍來往市區的路線改經大欖隧道，不再途經屏山至屯門。68M線的改動如下：
(1) 改經大欖隧道，不再途經屏山至華都花園。同時路線延長，來往朗屏邨至葵盛圍，取代原有元朗經葵涌往深水埗欽州街的68及68A線。同時路線提升至全空調巴士行走。
(2) 原屏山至華都花園段，由新開辦的63M線取代。
(3) 元朗段改經青山公路元朗段的擊壤路至朗日路一段。
最終，由於大欖隧道通車後，博愛交匯處的交通流量突然增加，一直以來均有塞車問題，加上68M線延長路線，導致班次嚴重不穩，使到元朗區乘客和議員不滿。因此，九巴在1998年6月再次重組大欖隧道的M線，68M線再次打回原形，來往元朗(西)至荃灣地鐵站，原本改以荃灣地鐵站為總站的64M線改回使用荃灣碼頭為總站。同時，九巴重開已取消的68A線，但只來往朗屏邨至葵興地鐵站，彌補68M線不再途經朗屏的不足。此路線一直維持至今，除了往荃灣方向現在改入形點I分站。
設多項轉乘優惠，遍佈全港各區
九巴在大欖隧道通車時，在大欖隧道收費站推出轉乘優惠，最初是以轉車票形式進行。68M線往荃灣方向，乘客在大欖隧道轉車站下車，向車長領取轉車票，可免費轉乘往荃灣或葵青區路線，或以優惠價轉乘往九龍或港島的九巴路線。往元朗方向，九巴推出元朗及天水圍路線互相免費轉乘，乘客在大欖隧道轉車站下車，並領取轉車票即可免費轉乘。此優惠在2002年改以八達通進行，並可以在大欖隧道轉車站後的分站才進行轉乘。
2002年，九巴推出68M線轉乘其他荃灣區內路線的轉乘優惠，包括31、36、235及238M線。當中部份路線的車費低於九巴提供的轉乘優惠金額，但乘搭這些路線轉乘68M線往元朗時，次程仍可獲得全數轉乘優惠金額，即乘搭兩程車的車費總和反而比只乘搭68M線為低。
2007年，九巴投得來往元朗至落馬州站(福田口岸)的路線B1，並在2007年8月15日配合該口岸啟用而投入服務。B1線一開辦便提供轉乘元朗所有九巴及龍運巴士路線的轉乘優惠，唯不包括968線。因此，68M線的乘客可以以優惠價轉車往福田口岸，前往中國內地。
九巴263M線在2013年9月，因客量極低及屯門公路轉車站全面啟用而取消。青山公路沿線雖然可以轉用68A線，到屯門公路轉車站轉乘其他往市區，但九巴仍然提供68A線在元朗區轉乘68M線的轉乘優惠，以取代263M線的大欖隧道轉乘優惠。
2014年10月，九巴大幅縮短251M線的服務時間及路線，從此大欖隧道再沒有路線覆蓋荃灣大河道及楊屋道。為補償受影響的乘客，九巴在68M線增設41M、42M及243M線的免費轉乘優惠。此優惠在2014年11月，264M線取消後，元朗大馬路再沒有路線往青衣，作為另一前往青衣的方法(其實乘客可以在大欖隧道轉乘68E或279X線前往)。
68F線在2015年11月開辦，並在2016年先後提升至每日全日服務，以及改為由峻巒循環來往元朗公園，並和元朗大馬路線推出轉乘優惠，可免去68F線車費。此優惠可以方便往元朗南，以及凹頭一帶。
除了巴士轉乘優惠外，68M線還增設專線小巴的轉乘優惠。九巴為載通國際旗下的公司，該公司另設有權君有限公司，並在2019年投得元朗其中三條專線小巴路線，其中一條為來往港頭村及元朗(鳳翔路)的623線。此路線在2020年3月開辦，並和多條元朗的九巴路線設有$1的轉乘優惠，當中包括68M線。
用車演變史
68M線最初和大部份元朗及屯門區路線一樣，使用利蘭勝利二型(G)行走。80年代中期，有「一代車皇」之稱的梅斯平治O305型(ME)加入行走，另加入利蘭奧林比安型(S3BL)，後兩者一直維持至大欖隧道通車。空調巴士服務在1992年開始提供，最初使用11米版本的利蘭奧林比安型(AL)及丹尼士巨龍(AD)，後者一直維持至大欖隧道通車後。
踏入2000年代，68M線和大部份元朗及屯門區的M線一樣，加入特低地台巴士行走，並以Neoplan Centroliner型(AP)為主。
2013年開始，九巴分批購買ADL Enviro 500 MMC型(ATENU)，68M線在2015年開始主要以此款車行走，取代上段所指，年事已高的Neoplan Cetnroliner型(AP)行走，並一直維持至今。此路線在2018年末獲批准行走12.8米巴士，故68M線現時間中會有12.8米的同款車(歐五版3ATENU，歐六版E6X行走)
2017年11月，九巴在元朗形點舉行期間限定店，並在2017年11月4至5日安排途經該處的68M線，行走當時推出不久的紅色車身巴士，包括ADL Enviro 500 MMC型(ATENU)以及富豪B9TL型(AVBWU)，用車由四廠臨時調入行走，並以「紅巴大巡遊」作為該兩日68M線的電子路線牌的間歇性題示。
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