背景
九巴在1998年5月，大欖隧道通車後把來往天水圍及觀塘的269C線改經大欖隧道，並提升為每日全日服務。不過，最初269C線同時途經天水圍及元朗，天水圍的乘客需要途經元朗大馬路才上快速公路，無疑會浪費時間，故部份天水圍的乘客寧乘搭其他直接由天水圍駛往大欖隧道的路線，並在大欖隧道轉車站轉乘269C線往觀塘，或由市區乘搭269C線到大欖隧道轉車站轉乘直接往天水圍的路線。
2004年2月23日，九巴分兩階段分拆269C線，並在同年8月完成。
路線分拆
第一階段分拆在2004年2月23日進行。269C線改為不再途經元朗，並開辦268C線，由朗屏西鐵站開出，並途經朗屏邨及水邊圍村後返回元朗大馬路。最初兩條路線只在星期一至六繁忙時間行走，其餘服務時段由臨時路線69C線行走。69C線同時途經天水圍及元朗才到市區，走線與原本的269C線一樣。
第二階段則在2004年8月15日進行，268C及269C兩線改為每日全日服務，自此正式全日「元天分家」，69C線同時亦同時停止服務。
用車方面，路線用車跟隨268C及269C線，主要使用12米的丹尼士巨龍型(3AD)及Neoplan Centroliner型(AP)行走。
路線編號復活
九巴在2005年10月增設269C線早上繁忙時間的天水圍北特別班次觀塘，並在2015年9月增設下午回程服務，並把此特別班次路線編號改為69C。至於第二代69C線的歷史，會在日後的章節詳述。